Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNT1O60563 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNT1O60563 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNT1O60563 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNT1O60563 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNT1O60563 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNT1O60563 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCNT1O60563 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCNT1O60563 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCNT1O60563 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCNT1O60563 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCNT1O60563 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNT1O60563 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNT1O60563 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNT1O60563 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNT1O60563 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNT1O60563 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNT1O60563 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNT1O60563 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNT1O60563 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNT1O60563 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNT1O60563 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNT1O60563 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNT1O60563 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNT1O60563 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNT1O60563 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNT1O60563 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNT1O60563 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNT1O60563 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNT1O60563 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCNT1O60563 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNT1O60563 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNT1O60563 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNT1O60563 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNT1O60563 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNT1O60563 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNT1O60563 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNT1O60563 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNT1O60563 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNT1O60563 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNT1O60563 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNT1O60563 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNT1O60563 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNT1O60563 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms