Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOBOXO60393 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOBOXO60393 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOBOXO60393 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOBOXO60393 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOBOXO60393 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOBOXO60393 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOBOXO60393 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOBOXO60393 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOBOXO60393 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOBOXO60393 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOBOXO60393 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NOBOXO60393 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOBOXO60393 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOBOXO60393 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOBOXO60393 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOBOXO60393 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOBOXO60393 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOBOXO60393 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NOBOXO60393 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOBOXO60393 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOBOXO60393 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms