Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME2P1O60361 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NME2P1O60361 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME2P1O60361 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME2P1O60361 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME2P1O60361 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME2P1O60361 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME2P1O60361 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME2P1O60361 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME2P1O60361 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME2P1O60361 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME2P1O60361 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME2P1O60361 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms