Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRODHO43272 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRODHO43272 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRODHO43272 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRODHO43272 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRODHO43272 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRODHO43272 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRODHO43272 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRODHO43272 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRODHO43272 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRODHO43272 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRODHO43272 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRODHO43272 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRODHO43272 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRODHO43272 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRODHO43272 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRODHO43272 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRODHO43272 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRODHO43272 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRODHO43272 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRODHO43272 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRODHO43272 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRODHO43272 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRODHO43272 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRODHO43272 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRODHO43272 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRODHO43272 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRODHO43272 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRODHO43272 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRODHO43272 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRODHO43272 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRODHO43272 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRODHO43272 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRODHO43272 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRODHO43272 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRODHO43272 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRODHO43272 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRODHO43272 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRODHO43272 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRODHO43272 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRODHO43272 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRODHO43272 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRODHO43272 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRODHO43272 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRODHO43272 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRODHO43272 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRODHO43272 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRODHO43272 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRODHO43272 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRODHO43272 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRODHO43272 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRODHO43272 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRODHO43272 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRODHO43272 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRODHO43272 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRODHO43272 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRODHO43272 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRODHO43272 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRODHO43272 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRODHO43272 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRODHO43272 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRODHO43272 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRODHO43272 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRODHO43272 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRODHO43272 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRODHO43272 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRODHO43272 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRODHO43272 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRODHO43272 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRODHO43272 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRODHO43272 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRODHO43272 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRODHO43272 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRODHO43272 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRODHO43272 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRODHO43272 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRODHO43272 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRODHO43272 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRODHO43272 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRODHO43272 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRODHO43272 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRODHO43272 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRODHO43272 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRODHO43272 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRODHO43272 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRODHO43272 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRODHO43272 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRODHO43272 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRODHO43272 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRODHO43272 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRODHO43272 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRODHO43272 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRODHO43272 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRODHO43272 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRODHO43272 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRODHO43272 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRODHO43272 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRODHO43272 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRODHO43272 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRODHO43272 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms