Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOCS1O15524 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOCS1O15524 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS1O15524 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms