Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1CO15160 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1CO15160 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms