Protein–RNA interactions for Protein: O15033

AREL1, Apoptosis-resistant E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AREL1O15033 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AREL1O15033 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AREL1O15033 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AREL1O15033 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AREL1O15033 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AREL1O15033 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AREL1O15033 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AREL1O15033 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AREL1O15033 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AREL1O15033 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
AREL1O15033 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AREL1O15033 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AREL1O15033 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AREL1O15033 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
AREL1O15033 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AREL1O15033 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AREL1O15033 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AREL1O15033 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AREL1O15033 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AREL1O15033 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AREL1O15033 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AREL1O15033 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AREL1O15033 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AREL1O15033 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AREL1O15033 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AREL1O15033 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AREL1O15033 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AREL1O15033 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AREL1O15033 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AREL1O15033 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
AREL1O15033 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AREL1O15033 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AREL1O15033 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AREL1O15033 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AREL1O15033 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AREL1O15033 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AREL1O15033 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AREL1O15033 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AREL1O15033 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AREL1O15033 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AREL1O15033 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AREL1O15033 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AREL1O15033 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AREL1O15033 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AREL1O15033 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AREL1O15033 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AREL1O15033 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AREL1O15033 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AREL1O15033 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AREL1O15033 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AREL1O15033 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AREL1O15033 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AREL1O15033 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AREL1O15033 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AREL1O15033 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AREL1O15033 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AREL1O15033 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AREL1O15033 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AREL1O15033 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AREL1O15033 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AREL1O15033 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AREL1O15033 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AREL1O15033 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AREL1O15033 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AREL1O15033 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AREL1O15033 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AREL1O15033 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AREL1O15033 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AREL1O15033 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AREL1O15033 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AREL1O15033 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AREL1O15033 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AREL1O15033 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AREL1O15033 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AREL1O15033 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AREL1O15033 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AREL1O15033 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AREL1O15033 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AREL1O15033 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AREL1O15033 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AREL1O15033 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AREL1O15033 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AREL1O15033 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AREL1O15033 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AREL1O15033 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AREL1O15033 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AREL1O15033 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AREL1O15033 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AREL1O15033 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AREL1O15033 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AREL1O15033 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AREL1O15033 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AREL1O15033 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AREL1O15033 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AREL1O15033 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AREL1O15033 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AREL1O15033 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AREL1O15033 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AREL1O15033 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AREL1O15033 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms