Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN9O14815 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN9O14815 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN9O14815 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN9O14815 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN9O14815 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN9O14815 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN9O14815 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN9O14815 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN9O14815 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN9O14815 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN9O14815 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN9O14815 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN9O14815 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN9O14815 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN9O14815 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN9O14815 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN9O14815 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN9O14815 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN9O14815 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN9O14815 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN9O14815 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN9O14815 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN9O14815 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN9O14815 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN9O14815 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN9O14815 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN9O14815 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN9O14815 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN9O14815 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN9O14815 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN9O14815 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN9O14815 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN9O14815 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN9O14815 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN9O14815 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms