Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRPO00591 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRPO00591 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRPO00591 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRPO00591 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRPO00591 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRPO00591 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRPO00591 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRPO00591 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRPO00591 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRPO00591 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRPO00591 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRPO00591 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRPO00591 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRPO00591 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRPO00591 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRPO00591 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRPO00591 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRPO00591 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRPO00591 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRPO00591 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRPO00591 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRPO00591 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRPO00591 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRPO00591 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRPO00591 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRPO00591 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRPO00591 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRPO00591 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRPO00591 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRPO00591 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRPO00591 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRPO00591 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRPO00591 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRPO00591 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRPO00591 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRPO00591 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRPO00591 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRPO00591 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRPO00591 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRPO00591 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRPO00591 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRPO00591 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRPO00591 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRPO00591 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRPO00591 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRPO00591 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRPO00591 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRPO00591 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRPO00591 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRPO00591 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRPO00591 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRPO00591 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRPO00591 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRPO00591 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRPO00591 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRPO00591 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRPO00591 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRPO00591 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRPO00591 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRPO00591 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRPO00591 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRPO00591 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRPO00591 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRPO00591 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRPO00591 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRPO00591 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRPO00591 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRPO00591 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRPO00591 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRPO00591 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRPO00591 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRPO00591 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GABRPO00591 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRPO00591 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRPO00591 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRPO00591 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRPO00591 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRPO00591 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRPO00591 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRPO00591 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRPO00591 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRPO00591 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRPO00591 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRPO00591 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRPO00591 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRPO00591 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRPO00591 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRPO00591 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRPO00591 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRPO00591 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRPO00591 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRPO00591 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRPO00591 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRPO00591 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRPO00591 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRPO00591 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRPO00591 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRPO00591 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRPO00591 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms