Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MEIS1O00470 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEIS1O00470 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MEIS1O00470 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MEIS1O00470 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MEIS1O00470 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MEIS1O00470 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MEIS1O00470 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
MEIS1O00470 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MEIS1O00470 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MEIS1O00470 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MEIS1O00470 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MEIS1O00470 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MEIS1O00470 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MEIS1O00470 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MEIS1O00470 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MEIS1O00470 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MEIS1O00470 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MEIS1O00470 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MEIS1O00470 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MEIS1O00470 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MEIS1O00470 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MEIS1O00470 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MEIS1O00470 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MEIS1O00470 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms