Protein–RNA interactions for Protein: J3KTA2

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KTA2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KTA2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KTA2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KTA2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KTA2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KTA2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KTA2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KTA2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3KTA2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3KTA2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3KTA2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3KTA2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3KTA2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3KTA2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3KTA2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
J3KTA2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
J3KTA2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
J3KTA2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
J3KTA2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
J3KTA2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
J3KTA2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
J3KTA2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
J3KTA2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
J3KTA2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
J3KTA2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
J3KTA2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3KTA2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3KTA2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3KTA2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3KTA2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3KTA2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3KTA2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
J3KTA2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
J3KTA2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
J3KTA2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
J3KTA2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
J3KTA2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
J3KTA2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KTA2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KTA2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KTA2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3KTA2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
J3KTA2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
J3KTA2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
J3KTA2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
J3KTA2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3KTA2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3KTA2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3KTA2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3KTA2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
J3KTA2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3KTA2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3KTA2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
J3KTA2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
J3KTA2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3KTA2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3KTA2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3KTA2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
J3KTA2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3KTA2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3KTA2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3KTA2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3KTA2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3KTA2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
J3KTA2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
J3KTA2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3KTA2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3KTA2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3KTA2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3KTA2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3KTA2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3KTA2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3KTA2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3KTA2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3KTA2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3KTA2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3KTA2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3KTA2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3KTA2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
J3KTA2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3KTA2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
J3KTA2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
J3KTA2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
J3KTA2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
J3KTA2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
J3KTA2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
J3KTA2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
J3KTA2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
J3KTA2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
J3KTA2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
J3KTA2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
J3KTA2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
J3KTA2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
J3KTA2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
J3KTA2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
J3KTA2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
J3KTA2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
J3KTA2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
J3KTA2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
J3KTA2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms