Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC179H3BU77 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC179H3BU77 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC179H3BU77 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms