Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPIPA2E9PIF3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPIPA2E9PIF3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPIPA2E9PIF3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPIPA2E9PIF3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms