Protein–RNA interactions for Protein: C9IYK1

Gap junction protein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9IYK1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9IYK1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9IYK1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9IYK1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9IYK1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9IYK1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9IYK1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9IYK1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9IYK1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9IYK1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C9IYK1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C9IYK1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C9IYK1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C9IYK1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C9IYK1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9IYK1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9IYK1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C9IYK1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C9IYK1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C9IYK1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C9IYK1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
C9IYK1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
C9IYK1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C9IYK1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
C9IYK1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C9IYK1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C9IYK1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C9IYK1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
C9IYK1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C9IYK1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
C9IYK1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C9IYK1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9IYK1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9IYK1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9IYK1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9IYK1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
C9IYK1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9IYK1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C9IYK1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C9IYK1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9IYK1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9IYK1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
C9IYK1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
C9IYK1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
C9IYK1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C9IYK1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C9IYK1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C9IYK1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9IYK1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9IYK1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9IYK1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9IYK1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9IYK1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9IYK1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9IYK1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9IYK1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9IYK1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9IYK1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9IYK1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9IYK1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9IYK1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9IYK1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9IYK1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9IYK1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
C9IYK1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
C9IYK1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9IYK1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9IYK1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9IYK1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C9IYK1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9IYK1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
C9IYK1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9IYK1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C9IYK1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C9IYK1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C9IYK1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C9IYK1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9IYK1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9IYK1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9IYK1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9IYK1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C9IYK1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
C9IYK1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C9IYK1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C9IYK1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C9IYK1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.56■■■□□ 2
C9IYK1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C9IYK1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C9IYK1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C9IYK1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C9IYK1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C9IYK1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C9IYK1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C9IYK1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C9IYK1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C9IYK1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C9IYK1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C9IYK1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.52■■■□□ 2
C9IYK1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
C9IYK1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms