Protein–RNA interactions for Protein: B4DLN1

cDNA FLJ60124, highly similar to Mitochondrial dicarboxylate carrier, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DLN1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
B4DLN1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
B4DLN1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
B4DLN1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
B4DLN1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
B4DLN1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
B4DLN1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
B4DLN1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
B4DLN1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
B4DLN1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
B4DLN1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
B4DLN1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
B4DLN1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
B4DLN1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
B4DLN1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
B4DLN1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
B4DLN1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
B4DLN1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
B4DLN1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
B4DLN1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
B4DLN1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
B4DLN1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
B4DLN1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
B4DLN1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
B4DLN1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
B4DLN1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
B4DLN1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
B4DLN1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
B4DLN1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
B4DLN1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
B4DLN1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
B4DLN1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
B4DLN1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
B4DLN1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
B4DLN1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
B4DLN1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
B4DLN1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
B4DLN1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
B4DLN1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
B4DLN1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
B4DLN1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
B4DLN1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
B4DLN1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
B4DLN1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
B4DLN1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
B4DLN1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
B4DLN1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
B4DLN1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
B4DLN1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
B4DLN1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
B4DLN1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
B4DLN1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
B4DLN1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
B4DLN1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
B4DLN1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
B4DLN1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
B4DLN1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
B4DLN1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
B4DLN1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
B4DLN1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
B4DLN1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
B4DLN1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
B4DLN1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
B4DLN1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
B4DLN1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
B4DLN1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
B4DLN1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
B4DLN1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
B4DLN1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
B4DLN1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
B4DLN1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
B4DLN1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
B4DLN1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
B4DLN1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
B4DLN1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
B4DLN1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
B4DLN1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
B4DLN1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
B4DLN1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
B4DLN1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
B4DLN1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
B4DLN1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
B4DLN1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
B4DLN1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
B4DLN1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
B4DLN1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
B4DLN1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
B4DLN1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
B4DLN1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
B4DLN1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
B4DLN1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
B4DLN1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
B4DLN1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
B4DLN1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
B4DLN1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
B4DLN1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
B4DLN1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
B4DLN1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
B4DLN1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
B4DLN1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms