Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU5

VSTM2B, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2BA6NLU5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VSTM2BA6NLU5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VSTM2BA6NLU5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VSTM2BA6NLU5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms