Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WIPF3A6NGB9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WIPF3A6NGB9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WIPF3A6NGB9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
WIPF3A6NGB9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms