Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN9

ANKUB1, Protein ANKUB1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKUB1A6NFN9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKUB1A6NFN9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKUB1A6NFN9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKUB1A6NFN9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKUB1A6NFN9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKUB1A6NFN9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKUB1A6NFN9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKUB1A6NFN9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKUB1A6NFN9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKUB1A6NFN9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKUB1A6NFN9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKUB1A6NFN9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKUB1A6NFN9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKUB1A6NFN9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKUB1A6NFN9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKUB1A6NFN9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKUB1A6NFN9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKUB1A6NFN9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKUB1A6NFN9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKUB1A6NFN9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ANKUB1A6NFN9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ANKUB1A6NFN9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKUB1A6NFN9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms