Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GOLGA6CA6NDK9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOLGA6CA6NDK9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms