Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRAMEF22A3QJZ6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PRAMEF22A3QJZ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRAMEF22A3QJZ6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRAMEF22A3QJZ6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRAMEF22A3QJZ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PRAMEF22A3QJZ6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PRAMEF22A3QJZ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
PRAMEF22A3QJZ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRAMEF22A3QJZ6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRAMEF22A3QJZ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRAMEF22A3QJZ6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRAMEF22A3QJZ6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRAMEF22A3QJZ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRAMEF22A3QJZ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRAMEF22A3QJZ6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PRAMEF22A3QJZ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRAMEF22A3QJZ6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRAMEF22A3QJZ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRAMEF22A3QJZ6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRAMEF22A3QJZ6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRAMEF22A3QJZ6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRAMEF22A3QJZ6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRAMEF22A3QJZ6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PRAMEF22A3QJZ6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRAMEF22A3QJZ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRAMEF22A3QJZ6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRAMEF22A3QJZ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRAMEF22A3QJZ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRAMEF22A3QJZ6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRAMEF22A3QJZ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRAMEF22A3QJZ6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRAMEF22A3QJZ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
PRAMEF22A3QJZ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRAMEF22A3QJZ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRAMEF22A3QJZ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PRAMEF22A3QJZ6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRAMEF22A3QJZ6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRAMEF22A3QJZ6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRAMEF22A3QJZ6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRAMEF22A3QJZ6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRAMEF22A3QJZ6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRAMEF22A3QJZ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRAMEF22A3QJZ6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRAMEF22A3QJZ6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRAMEF22A3QJZ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRAMEF22A3QJZ6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRAMEF22A3QJZ6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRAMEF22A3QJZ6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRAMEF22A3QJZ6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRAMEF22A3QJZ6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PRAMEF22A3QJZ6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRAMEF22A3QJZ6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRAMEF22A3QJZ6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRAMEF22A3QJZ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRAMEF22A3QJZ6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms