Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PRG6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PRG6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1W2PRG6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1W2PRG6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PRG6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PRG6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PRG6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PRG6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PRG6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PRG6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PRG6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PRG6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PRG6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PRG6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PRG6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PRG6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PRG6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PRG6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PRG6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PRG6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PRG6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A1W2PRG6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1W2PRG6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PRG6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PRG6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PRG6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PRG6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PRG6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PRG6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PRG6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PRG6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PRG6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PRG6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PRG6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PRG6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PRG6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms