Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ERMAP-202ENST00000372514 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 DAZ3-203ENST00000446723 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 DAZ2-209ENST00000449947 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ENPEP-201ENST00000265162 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RALBP1-202ENST00000383432 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-246ENST00000638848 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRG1-201ENST00000388813 3925 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RPAP1-202ENST00000561603 3906 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CPT1B-207ENST00000457250 2217 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CLIP1-218ENST00000545889 4633 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ARID1B-210ENST00000635849 5830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF15-202ENST00000421050 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS6KB1-201ENST00000225577 5375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 USP54-204ENST00000422491 2777 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMPD2-213ENST00000636244 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 EMP1-201ENST00000256951 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GID8-201ENST00000266069 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GBP4-201ENST00000355754 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 FP565324.1-201ENST00000636427 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SYK-202ENST00000375747 4908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2B2-202ENST00000360273 8962 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF2-204ENST00000617923 3885 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRE5-201ENST00000242786 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF507-202ENST00000355898 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC8A3-207ENST00000528359 2840 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MPI-213ENST00000566377 2809 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NIPAL3-201ENST00000003912 5481 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ARMC8-210ENST00000469044 4790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZEB2-224ENST00000539609 4061 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CD302-201ENST00000259053 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SUPT5H-213ENST00000598725 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 VARS2-213ENST00000625423 3362 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ARMCX5-206ENST00000604957 4640 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TACC2-212ENST00000453444 9158 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RC3H2-202ENST00000357244 3991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PAX6-209ENST00000419022 6888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RAPGEF3-219ENST00000549151 3265 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV3-32-201ENST00000390303 383 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPB1P1-201ENST00000423240 256 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01627-201ENST00000452923 243 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL484P-201ENST00000462651 202 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRPCP10-201ENST00000481033 210 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010608.1-201ENST00000507964 275 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01606-205ENST00000519314 562 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ALG1L9P-205ENST00000532875 549 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC002094.3-201ENST00000555059 851 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006441.2-201ENST00000580084 302 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL804P-201ENST00000582466 298 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005291.2-201ENST00000609088 523 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPA3-202ENST00000411529 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF780A-201ENST00000340963 3674 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MVK-213ENST00000625889 2591 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 USP31-201ENST00000219689 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SCMH1-206ENST00000372596 3323 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3TC2-215ENST00000515425 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 STRADA-201ENST00000245865 2959 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GNAT1-201ENST00000232461 2417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PAQR8-201ENST00000360726 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RRP8-201ENST00000254605 6560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms