Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP19-10P-201ENST00000445258 187 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL291P-201ENST00000487916 289 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC096996.2-201ENST00000563906 426 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL493P-201ENST00000580401 299 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL140P-201ENST00000581321 294 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 APOC1-205ENST00000589781 273 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002505.1-201ENST00000592655 228 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.148-201ENST00000614489 291 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.30-201ENST00000621054 280 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CTBP1-219ENST00000629223 210 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 STAU2-215ENST00000521727 3953 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF266-206ENST00000592292 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CUL9-202ENST00000372647 7684 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 C1orf226-203ENST00000458626 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LPIN3-205ENST00000632009 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 UBA7-201ENST00000333486 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL360004.1-201ENST00000358748 3258 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ORAI2-201ENST00000356387 10811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA4D-201ENST00000339861 4258 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 HIPK1-206ENST00000369559 3424 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 VIPAS39-211ENST00000557658 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP16-1-201ENST00000391352 1554 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ANO2-211ENST00000546188 3702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CSPG4P5-201ENST00000558731 3730 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP36-203ENST00000370922 2736 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CAPZA2-201ENST00000361183 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ASTN1-203ENST00000367657 4187 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPRSS3-201ENST00000291532 3193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MTHFD1L-212ENST00000618312 3159 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLFN13-211ENST00000542635 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GART-203ENST00000381815 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 APBB2-201ENST00000295974 8972 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AARS-201ENST00000261772 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP30-203ENST00000368016 3482 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTS7P4-206ENST00000561209 3611 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPT-AS1-204ENST00000634876 3602 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF518A-201ENST00000316045 7277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GHR-212ENST00000620156 4529 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPRSS4-220ENST00000618855 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TNS1-202ENST00000310858 1792 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TTPAL-201ENST00000262605 6212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GBA-203ENST00000427500 2063 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFS1-203ENST00000432169 2080 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN1-201ENST00000371621 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TIA1-205ENST00000433529 4647 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SMG7-212ENST00000507469 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 FRY-202ENST00000380250 10688 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 FRY-209ENST00000642040 10697 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF248-203ENST00000395867 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 DAB2-201ENST00000320816 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 DAB2-217ENST00000545653 4537 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TBPL1-201ENST00000237264 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ERMAP-201ENST00000328249 3949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ADCY10P1-202ENST00000457653 3785 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC135048.4-201ENST00000624286 3641 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MX1-203ENST00000398600 3470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF31-211ENST00000559275 3198 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TARS2-204ENST00000369064 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 P4HA2-205ENST00000379104 2569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TLN2-211ENST00000636159 7441 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC14-203ENST00000412756 4568 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TACC2-203ENST00000358010 3815 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHM3-204ENST00000457206 3689 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3CD-201ENST00000361110 3508 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3CD-207ENST00000543390 3503 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LIMK1-202ENST00000418310 3360 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CD5-201ENST00000347785 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC020912.1-201ENST00000638312 5059 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ITIH1-201ENST00000273283 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms