Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00667-205ENST00000582008 3979 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 PDLIM5-201ENST00000317968 6083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RFFL-212ENST00000584655 4039 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CDH2-201ENST00000269141 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAH11-212ENST00000620169 13670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 PAH-215ENST00000553106 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 C16orf96-201ENST00000444310 3823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 NT5E-201ENST00000257770 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 PAXBP1-AS1-201ENST00000440052 3523 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SCMH1-203ENST00000361191 2906 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF37BP-202ENST00000452075 8637 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 GRIK1-207ENST00000399914 3624 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 DHX35-201ENST00000252011 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC40-204ENST00000397545 4294 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 HELQ-204ENST00000510985 3315 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 TGFBR1-209ENST00000552516 5933 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 GYS1-201ENST00000263276 3378 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RECQL5-203ENST00000420326 3710 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 PPFIA2-214ENST00000549325 4727 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 TMPRSS4-219ENST00000616579 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 EXOC7-221ENST00000634349 2124 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 HNRNPDL-201ENST00000295470 3781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CNGA3-203ENST00000393504 3841 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CSNK1G1-201ENST00000303052 8179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNA4-201ENST00000328224 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF827-208ENST00000513320 3165 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 TENM2-203ENST00000518659 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRP5-201ENST00000390649 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ZMYND8-213ENST00000461685 3567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 LAMB3-202ENST00000367030 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP2R2A-202ENST00000380737 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF275-202ENST00000370251 6320 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 LONP2-203ENST00000535754 2580 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 HNRNPA3-202ENST00000411529 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SMARCA2-258ENST00000637103 5657 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ZSCAN20-201ENST00000361328 4316 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNMA1-228ENST00000638223 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 DOK6-201ENST00000382713 8890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 KCND1-202ENST00000376477 3306 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SUPT20H-205ENST00000464744 2625 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SZT2-209ENST00000562955 13968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ACSF3-218ENST00000614302 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-47P-201ENST00000362966 163 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-21P-201ENST00000363327 163 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR885-201ENST00000401316 74 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 FUNDC2P4-201ENST00000441207 421 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 AL109933.1-201ENST00000448126 292 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL865P-201ENST00000466711 289 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL62P-201ENST00000498506 297 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms