Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ6

KRTAP4-11, Keratin-associated protein 4-11, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-11Q9BYQ6 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 OXCT1-201ENST00000196371 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SOX5-210ENST00000537393 2769 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 EIF4ENIF1-201ENST00000330125 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TIMP2-203ENST00000585421 3345 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 HDAC9-229ENST00000622668 4279 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SEMA4G-201ENST00000210633 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MATR3-201ENST00000394805 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DDX3Y-202ENST00000360160 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 KIF24-201ENST00000379174 5729 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TEX14-202ENST00000349033 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLC13A3-210ENST00000472148 3283 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 GOLGA8A-202ENST00000432566 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TXNRD1-208ENST00000525566 3836 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MYO1E-201ENST00000288235 8673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 STK36-201ENST00000295709 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 GPHN-201ENST00000315266 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DDHD1-210ENST00000612692 12339 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 THSD7B-203ENST00000413152 5846 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 HK1-203ENST00000360289 3961 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 BBS7-201ENST00000264499 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CNTNAP4-201ENST00000307431 4867 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CNTNAP4-207ENST00000611870 4867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CSNK1G1-201ENST00000303052 8179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CDCA8-202ENST00000373055 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLC34A2-201ENST00000382051 4122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DIAPH1-211ENST00000518047 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC007938.4-201ENST00000610046 4118 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNF41-201ENST00000345093 5596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DAZ3-203ENST00000446723 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DAZ2-209ENST00000449947 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 EPHB2-204ENST00000400191 10816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 HCG18-238ENST00000449544 4262 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 FLNB-AS1-202ENST00000488720 3709 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 FBXL17-206ENST00000619412 4059 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DOPEY2-202ENST00000399151 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 PPFIBP2-216ENST00000530181 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CALU-206ENST00000542996 4225 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RAB3GAP1-201ENST00000264158 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 GALNT15-206ENST00000617544 2775 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 BBS9-203ENST00000355070 4004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CD302-202ENST00000429078 3803 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RUBCN-201ENST00000273582 6955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 METTL2B-204ENST00000480046 5743 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 PCBP2-206ENST00000455667 2741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 KLHL20-201ENST00000209884 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SS18L1-201ENST00000331758 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AP001180.1-201ENST00000562202 3566 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DDX23-201ENST00000308025 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TRPV1-202ENST00000399756 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZMYM3-205ENST00000373984 5253 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ATP1A2-201ENST00000361216 5421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TBC1D8B-201ENST00000276175 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SYT6-202ENST00000607941 4352 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 PGK1-201ENST00000373316 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 PAX6-231ENST00000606377 6901 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SMPD4-201ENST00000351288 3661 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AF254983.1-201ENST00000612267 3336 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.5 ms