RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391058.1

RNU6-1177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1177P-201ENST00000391058 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CHIC1Q5VXU3 224 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1177P-201ENST00000391058 POTEDQ86YR6 584 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FOXD1Q16676 465 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MSH5O43196 834 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
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RNU6-1177P-201ENST00000391058 ADRA2BP18089 450 aa5.45□□□□□ -1.54
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PLPPR3Q6T4P5 718 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DMRT2Q9Y5R5 561 aa5.17□□□□□ -1.58
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RNF39Q9H2S5 420 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1177P-201ENST00000391058 POTEHQ6S545 545 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
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RNU6-1177P-201ENST00000391058 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DSG3P32926 999 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
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RNU6-1177P-201ENST00000391058 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1177P-201ENST00000391058 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CHRDL2Q6WN34 429 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ABCB7O75027 752 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TRHP20396 242 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PLSCR2Q9NRY7 297 aa4.3□□□□□ -1.72
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RNU6-1177P-201ENST00000391058 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
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RNU6-1177P-201ENST00000391058 APLP2Q06481 763 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-1177P-201ENST00000391058 EVX2Q03828 476 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LHX8Q68G74 356 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-1177P-201ENST00000391058 AKT1S1Q96B36 256 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP4.18□□□□□ -1.74
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC4A2P04920 1241 aa4.17□□□□□ -1.74
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
RNU6-1177P-201ENST00000391058 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
RNU6-1177P-201ENST00000391058 POLA2Q14181 598 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PITPNM1O00562 1244 aa4.13□□□□□ -1.75
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RNU6-1177P-201ENST00000391058 GABBR2O75899 941 aa4.11□□□□□ -1.75
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RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-1177P-201ENST00000391058 POTEMA6NI47 508 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1177P-201ENST00000391058 POTEGQ6S5H5 508 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1177P-201ENST00000391058 OTUD5Q96G74 571 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PCDH10Q9P2E7 1040 aa3.95□□□□□ -1.78
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RNU6-1177P-201ENST00000391058 CLEC11AQ9Y240 323 aa3.91□□□□□ -1.78
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RNU6-1177P-201ENST00000391058 DCBLD2Q96PD2 775 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
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RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPDYE6P0CI01 402 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CD44P16070 742 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
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RNU6-1177P-201ENST00000391058 KCNA4P22459 653 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRR29P0C7W0 189 aa3.79□□□□□ -1.8
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RNU6-1177P-201ENST00000391058 SSUH2Q9Y2M2 353 aa3.78□□□□□ -1.8
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RNU6-1177P-201ENST00000391058 POTEJP0CG39 1038 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CDAN1Q8IWY9 1227 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FBLN2P98095 1184 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZRANB1Q9UGI0 708 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MAMSTRQ6ZN01 415 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-1177P-201ENST00000391058 METRNQ9UJH8 293 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MMRN1Q13201 1228 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP3.69□□□□□ -1.82
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RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC39A7Q92504 469 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SCUBE2Q9NQ36 999 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPNS2Q8IVW8 549 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FOXD4L1Q9NU39 408 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PHF12Q96QT6 1004 aa3.66□□□□□ -1.82
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