Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0930-202ENST00000336156 8119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 VIL1-201ENST00000248444 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FGD3-203ENST00000416701 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC2A5-202ENST00000377424 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 BACH2-210ENST00000537989 9108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SKIV2L-201ENST00000375394 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSCAN32-201ENST00000304926 3027 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AMPD3-202ENST00000396553 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CTCFL-201ENST00000243914 3567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 INSC-203ENST00000424273 2943 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RHBDF2-215ENST00000591885 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIA1-209ENST00000518783 5233 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KXD1-217ENST00000602094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NDE1-202ENST00000396355 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TWNK-202ENST00000370228 3175 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MTTP-208ENST00000511045 3154 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CTC1-201ENST00000315684 7021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 C2orf71-201ENST00000331664 7044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ACTN3-201ENST00000502692 3084 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMPD2-202ENST00000374201 4997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NEXMIF-201ENST00000055682 11719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CLASP2-209ENST00000468888 6978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MED22-210ENST00000614493 3886 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC8D-202ENST00000394593 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ANGPT4-201ENST00000381922 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SUPT5H-203ENST00000402194 3698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PUM2-204ENST00000403432 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPC5-201ENST00000262839 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ACVR1-201ENST00000263640 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CDC42SE1-202ENST00000439374 3498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CYBRD1-201ENST00000321348 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMTA2-203ENST00000381311 4374 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR3B-201ENST00000228347 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KALRN-201ENST00000240874 6537 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH11Y-202ENST00000333703 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PLA2G4C-201ENST00000354276 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KALRN-211ENST00000460856 6509 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01347-202ENST00000627498 3841 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MROH5-205ENST00000621837 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MUC6-201ENST00000421673 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM193A-203ENST00000502458 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 OSBPL6-205ENST00000392505 3637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF37A-206ENST00000638053 4448 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX46-202ENST00000452510 5689 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF5A-201ENST00000286452 3527 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 UTY-201ENST00000329134 4325 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZAN-205ENST00000613979 8669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PPEF2-201ENST00000286719 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM255A-203ENST00000371369 3425 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP5A1-202ENST00000398752 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DMBT1-203ENST00000344338 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 DMBT1-205ENST00000368955 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 C3orf20-201ENST00000253697 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 COL25A1-202ENST00000399127 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 WIPF2-201ENST00000323571 7474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NLK-201ENST00000407008 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC8A1-209ENST00000408028 2898 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LASP1-203ENST00000433206 4023 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 EHD2-201ENST00000263277 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TMC8-202ENST00000589691 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LRTOMT-203ENST00000324866 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB3GAP2-202ENST00000358951 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 STAT3-213ENST00000588969 2772 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 JUP-203ENST00000393931 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA64.2-201ENST00000362696 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms