Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN3Q9Y4C0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms