Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIF3AQ9Y496 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms