Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y467

SALL2, Sal-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL2Q9Y467 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SALL2Q9Y467 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL2Q9Y467 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms