Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms