Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
CTNND2Q9UQB3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNND2Q9UQB3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms