Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2IRD1Q9UHL9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms