Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHBDL2Q9NX52 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms