Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms