Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC4Q9NTJ3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC4Q9NTJ3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms