Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARHGEF4Q9NR80 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms