Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM6SF1Q9BZW5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM6SF1Q9BZW5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms