Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC106Q9BWC9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC106Q9BWC9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms