Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC94Q9BW85 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms