Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RTKNQ9BST9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms