Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C2orf88Q9BSF0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C2orf88Q9BSF0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.4 ms