Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLCC1Q96S66 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCC1Q96S66 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms