Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
VCPIP1Q96JH7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VCPIP1Q96JH7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms