Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EAF1Q96JC9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EAF1Q96JC9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms