Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPSB1Q96BD6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms