Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms