Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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GTF3C6Q969F1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
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GTF3C6Q969F1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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GTF3C6Q969F1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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GTF3C6Q969F1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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GTF3C6Q969F1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
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GTF3C6Q969F1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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GTF3C6Q969F1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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GTF3C6Q969F1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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