Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00301Q8NCQ3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms