Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms